Зал Якуси-до (также известный как зал Рури-дэн) был построен в 747 году, когда свирепствовала эпидемия оспы. В зале стоят статуи Будды медицины Якуси Нёрай, бодхисаттв лунного и солнечного света (Никко, Гакко), а также повторяющие сутру Якуси-кё (Сутра Будды медицины) статуи 12 божественных генералов, которые являются защитниками верующих буддистов. Говорят, что в то время, когда Нара была столицей, монах по имени Гёки посетил эти земли и по приказу (просьбе) императора Сёму освятил изображение Будды медицины. Кстати, Гёки также сыграл важную роль в строительстве храма Тодайдзи и был первым в Японии назначенным буддийским священником самого высокого ранга.

Трехярусная пагода была построена в 823 году. Высота башни составляет около 25 метров, и она входит в число самых больших башен, построенных в ту эпоху. В прошлом буддийский храмовый комплекс Сякубудзи занимал территорию 1 ри (около 4 км) с юга на север и 2 ри к востоку, считалось, что это был очень влиятельный храм, в котором служило множество монахов гакурё (монахи, которые изучают буддизм) и который владел более чем 70-ю таттюдзюин (небольшие храмы в горах).