Chùa Yakushi (còn được gọi là điện Ruri) được xây dựng vào năm 747, khi bệnh dịch đậu mùa đang lan rộng. Trong chùa có đặt "Như Lai Dược sư", "Nhật Quan và Nguyệt Quan Bồ Tát", "Tượng 12 vị thần" bảo vệ những tín đồ Phật giáo tụng kinh Dược Sư. Người ta kể rằng trong thời kỳ đóng đô ở Nara, một nhà sư tên là Gyoki đã đến thăm khu vực này và khai nhãn bức tượng Như Lai Dược Sư theo yêu cầu của Thiên hoàng Shomu. Nhân tiện, nhà sư Gyoki cũng dốc sức vào việc xây dựng chùa Todai và là người đầu tiên được bổ nhiệm cấp bậc cao nhất, đại lão hòa thượng, tại Nhật Bản

Tháp ba tầng được xây dựng vào năm 823. Tháp cao khoảng 25 mét và là một trong những tháp lớn nhất của thời đại này. Trước đây chùa Shakubu có lãnh thổ dài 1 lý (khoảng 4 km) về hai phía bắc nam và 2 lý về hai phía đông tây, có thế lực lớn mạnh nhất với nhiều sư tăng (nhà sư học về Phật giáo) ở đây và số lượng các viện trong chùa được cho là đã vượt quá 70.